|
StrucGAP: 糖蛋白质组学数据挖掘平台
当前位置: 中文主页 >> StrucGAP: 糖蛋白质组学数据挖掘平台构建了一套模块化、可扩展、可溯源的糖蛋白质组学数据挖掘平台 StrucGAP。该平台集成了包括数据预处理、糖蛋白/糖基化位点表征、聚糖结构解析、糖肽定量差异分析、功能注释、糖基化调控/互作网络构建、结果可视化、及关键信息提取八大核心模块,内置39种可视化工具,默认输出600余项分析结果,有效应对糖蛋白质组学数据维度高、结构复杂、信息整合难的挑战。平台聚焦糖链亚结构,从多层面提取关键差异特征,并与上游调控酶、互作蛋白及下游通路关联构建调控互作网络,通过关键信息提炼模块仅展示核心变化,便于快速聚焦和开展下游研究(Nature Communications, 2026a)。
StrucGAP 源代码链接:1) GitHub: https://github.com/Sun-GlycoLab/StrucGAP; 2) Zenodo: https://doi.org/10.5281/zenodo.18523067
使用说明:https://strucgap.readthedocs.io/en/latest/index.html
论文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-026-70560-7
文章引用
Muyao Yang#, Yongqi Wu#, Zhida Zhang#, Yongchao Xu, Tianjia Lei, Xiaohan Wang, Zhehui Jin, Ke Hou, Yinli Cai, Shisheng Sun*. StrucGAP: a modular, streamlined and traceable data mining platform for structural and site-specific glycoproteomics. Nature Communications. 2026, 17: 2579.

