孙士生，西大生科院教授，博士生导师。国家海外高层次青年人才项目 和 陕西省百人计划青年项目获得者。

 糖质（Glycan）是由多种单糖连接在一起形成的复杂结构，蕴含着极其丰富的生命信息，被称为继核酸和蛋白质之后的"第三条生命链"（详见美国国家科学院报告《转化糖科学：未来的风向标》解读）。糖质与核酸、蛋白质、脂类一样，是四大生命物质之一，存在于所有生物细胞的表面（详见英文教科书）。随着人类基因组和蛋白质组计划的完成，糖组和糖蛋白质组研究成为了全面系统了解生命的关键一环（详见本人文章）。本世纪以来，世界各国相继启动糖科学研究计划，其中包括日本于2023年投入321亿日元启动的人类糖组计划（详见新闻报道）。我国的糖科学研究计划“破译生命的糖质密码”经过充分论证，也已正式启动。但由于聚糖结构的复杂多样性和蛋白糖基化的微不均一性，且糖链合成不受DNA的直接控制，糖基化分析依然存在分析难、预测难和功能验证难等技术难题。

    针对糖基化分析领域的技术瓶颈，团队长期聚焦糖蛋白质组学新技术的研发与应用研究。已取得的成果包括：基于化学酶策略建立的NGAG方法实现了N-糖蛋白质的全面系统分析；StrucGP软件首次实现无需糖链结构数据库即可解析每个糖基化位点上的N-糖链结构；研发中的O-糖肽分析软件也正在攻克完整糖肽上成簇O-糖链的结构解析难题；StrucGAP分析平台通过八大核心模块实现组学数据的深度挖掘与可视化；预测模型SpecGP在糖肽结构图谱预测及鉴定准确性提升方面取得突破。上述工作逐步完成了从上游高质量样品制备，到中游高精度图谱解析和软件开发，再到下游数据深度挖掘及模型训练的全覆盖。借助上述新技术，证实了细胞核N-糖蛋白的存在及其重要功能；揭示了N-糖链的组织特异性分布规律，以及多种组织衰老过程中的糖基化改变模式；借助卵巢癌大队列明确了糖蛋白质组学图谱在肿瘤分子分型等临床应用中的巨大潜力；在原发性肝癌研究中发现了肝内胆管癌特异性“分子标签”，并结合分子生物学技术阐明了糖基化改变调控肝癌上皮间质转化（EMT）进程的新机制。这些研究迈出了从基础研究到应用探索的关键一步，为疾病研究提供了新视角。

    相关研究在 Cell、Nature Biotechnology 、Nature Communications 等期刊发表 SCI 论文 92 篇 (含已接收)。其中近5年以通讯作者在 Nature Methods、Nature Machine Intelligence、Nature Cell Biology、Nature Communications (2x)、Advanced Science、Redox Biology 等杂志发表SCI 论文 40 篇（含已接收）; 申请并获批中美专利 9 项。

科研条件：实验室配备全套蛋白质组和糖蛋白质组学分析平台，包括：OrbitrapFusion Lumos三合一 质谱仪，HPLC 1260 (Agilent)及多种蛋白质组和糖蛋白质组学分析软件。具备分子生物学实验平台，并与西安多家医院和计算机科研团队建立了稳定合作。

科研项目：自2017年回国以来，获批并主持 7 项国家级科研项目，包括国家海外高层次青年人才、国家重点研发项目子课题、国家自然科学基金重大研究计划（培育项目 x2）、面上项目 x2 、青年项目 x1；以及 4  项陕西省自然科学基金 (特别支持 x1、重点 x2、面上 x1)。指导团队青年教师和博士后申请并获批国家重点研发子课题、国家自然科学基金青年项目、国家博士后基金特别资助和面上资助、陕西省面上和青年基金等科研项目 10 余项。

社会兼职：担任中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业分会委员，中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业委员会青年工作委员会委员，中国生物工程学会青年工作委员会委员，陕西省细胞生物学学会糖生物学专业委员会副主任委员兼秘书长。担任Nat Biotechnol, Nat Methods, Nat Commun, Cell Res, Adv Sci, Nucleic acid Res, Theranostics, TRAC  等 40 多本杂志的专业审稿人。

2. 科研获奖：科研成果获得陕西高等学校科学技术研究优秀成果奖2023年度特等奖 (第一完成人)，陕西省第十五届自然科学优秀学术论文奖二等奖 (2022年度，唯一通讯作者) 。指导博士后和研究生获得第一届和第二届惠永正糖科学奖优秀学业奖 (2人次)、第三届全国糖复合物优秀论文奖一等奖、首届中国科协青年人才托举工程博士生专项计划 、国际Glyco26青年学者会议旅行奖、全国学术会议优秀论文奖 (2人次)、陕西省青年人才托举计划、陕西省优秀毕业生 (2人次)、陕西省第六届研究生创新成果奖一等奖，西北大学生命科学与医学部优秀毕业生 (3人次)、吴庆云奖学金 (3人次)、十佳研究生 (2人次)、学术活动月优秀海报奖一等奖 (3 人次)、研究生国家奖学金 (8 人次)、西北大学一等奖学金 (28 人次) 等科研奖励。

招纳贤才：欢迎具有生命科学、医学、分析化学、计算机、生物信息学 等相关学科背景的青年学者、博士后、博/硕士研究生加入我们。组学软件系统开发和大数据模型已成为我们实验室的独特方向之一，期待具有计算机、人工智能、生物信息学等科研技能的优秀青年加入。青年学者可以选择 特聘副教授 或者“紫藤学者”支持计划。博士研究生可以申请“申请-考核制”。主要研究方向包括：糖肽样品富集和生物质谱解析新方法、糖蛋白质组学软件系统开发、生命组学大数据挖掘、模型训练、大模型建立；应用研究包括：基于组学技术的肿瘤标志物发现、分子分型、和肿瘤发生发展分子机制研究，以及肿瘤免疫、衰老、脑科学等。

代表性文章：

1. Xianyong Wang#, Rui Song#, Zhuangzhuang Feng, Shisheng Sun*. SpecGP as A Transformer-Based Model for Predicting Energy-adaptable Structural Spectra of Glycopeptides. Nature Machine Intelligence. 2026, Accepted in principle. IF = 23.9.

2. Xiuxiao Tang#, Ranran Dai#, Li Qing#, Zhida Zhang#, ..., Yang Mao*, Shisheng Sun*, and Junjun Ding*. Nuclear polysaccharides maintain H3K9me3-heterochromatin and genomic stability. Nature Cell Biology, 2026, Accepted. IF = 19.5.

3. Muyao Yang#, Yongqi Wu#, Zhida Zhang#, Yongchao Xu, Tianjia Lei, Xiaohan Wang, Zhehui Jin, Ke Hou, Yinli Cai, Shisheng Sun*. StrucGAP: a modular, streamlined and traceable data mining platform for structural and site-specific glycoproteomics. Nature Communications. 2026, 17: 2579. IF = 15.7.

4. Yongqi Wu#, Muyao Yang#, Yongchao Xu#, Li Jia#, Jun Li, Xiaohan Wang, Jiayu Zhao, Yinli Cai, Yiwen Zhang, Shisheng Sun*. A Comprehensive N-Glycoproteome Atlas Reveals Tissue-Specific Glycan Remodeling but Non-random Structural Microheterogeneities. Nature Communications. 2026, 17: 1448. IF = 15.7.

5. Jiechen Shen^#, Li Jia^#, Liuyi Dang^#, Yuanjie Su^#, Jie Zhang, Yintai Xu, Bojing Zhu, Zexuan Chen, Jingyu Wu, Rongxia Lan, Zhifang Hao, Chen Ma, Ting Zhao, Ni Gao, Jieyun Bai, Yuan Zhi, Jun Li, Junying Zhang, Shisheng Sun*. StrucGP: de novo structural sequencing of site-specific N-glycan on glycoproteins using a modularization strategy. Nature Methods. 2021, 18: 921-929. IF = 47.99. 

6. Jianbo Pan^#, Yingwei Hu^#, Shisheng Sun^#, Lijun Chen, Michael Schnaubelt, David Clark, Minghui Ao, Zhen Zhang, Daniel Chan, Jiang Qian, Hui Zhang*. Glycoproteomics-based signatures for tumor subtyping and clinical outcome prediction of high-grade serous ovarian cancer. Nature Communications. 2020, 11 (1): 6139. IF = 14.9.

7. Shisheng Sun, Punit Shah, Shadi Toghi Eshghi, Weiming Yang, Namita Trikannad, Shuang Yang, Lijun Chen, Paul Aiyetan, Naseruddin Höti, Zhen Zhang, Daniel W. Chan, Hui Zhang*. Comprehensive analysis of protein glycosylation by solid-phase extraction of N-linked glycans and glycosite-containing peptides. Nature Biotechnology. 2016, 34: 84-88. IF = 41.667.

8. Zhida Zhang, Yongqi Wu, Ke Hou, Yiwen Zhang, Lin Chen, Muyao Yang, Zhehui Jin, Yongchao Xu, Yingjie Zhang, Yinli Cai, Jiayu Zhao, Shisheng Sun*. A Glycoproteome Data Mining Strategy for Characterizing Structural Features of Altered Glycans with Thymic Involution. Advanced Science, 2025, 12(38): e02013. IF = 14.1.

9. Yongqi Wu, Zhida Zhang, Yongchao Xu, Yingjie Zhang, Lin Chen, Yiwen Zhang, Ke Hou, Muyao Yang, Zhehui Jin, Yinli Cai, Jiayu Zhao, Shisheng Sun*. A High-resolution N-Glycoproteome Landscape of Aging Mouse Ovary. Redox Biology. 2025, 81: 103584. IF = 11.9.