对于二倍体，通过电泳带型可以直接得到基因型，如扩增出一条带是纯合子（基因型AA），扩增出两条带则是杂合子（基因型AB）；而多倍体则复杂得多，例如四倍体扩增出两条带则有三种可能的基因型（AAAB、AABB、ABBB），无法直接获取基因型，称为“歧义基因型”。另一方面，多体遗传具有特殊的“双减数”现象，表现在姐妹染色单体片段在减数分裂中分离至同一配子，如ABCD型合子可产生AA型配子。该现象能够让配子携带同源等位基因，表现出类似近交的效果，导致基因型频率偏离Hardy-Weinberg平衡，影响后续分析。

成果：建立新的同源多倍体的减数分裂模型，并推导了多体遗传在各种减数分裂模型下的基因型频率的符号解（Huang et al. 2019 G3），得到了多体遗传在各种减数分裂模型下的基因型频率的符号解，为之后的群体遗传学分析提供了理论基础；提出通过分子表型对多倍体进行各类群体遗传学分析的方法，使用基因型后验概率进行加权，通过四种途径（表型法、加权法、等位基因频率法、伪等位基因法）推广了一系列分析方法到多倍体，解决以上两方面的问题，使之前无法完成的分析成为可能，极大地拓展了多倍体的分析方法，为多倍体的分子生态学、基因组学等方面研究提供了有力的支持（Huang et al. 2020 Methods in Ecology & Evolution）；提出通过分子表型鉴定个体倍性的方法（Huang et al. 2019 Molecular Ecology Resources）；拓展分子方差分析，可在任意数目等级划分和任意倍性的条件下进行分子方差分析（Huang et al. 2020 Integrative Zoology），能够更好地解释物种的种群遗传结构。